คลังผลงานวิจัย กรมวิชาการเกษตร

รายงานผลงานวิจัยและพัฒนา

การใช้ดีเอ็เอบาร์โค้ดเพื่อจัดจำแนกเชื้อรา Beauveria bassiana

คำหลัก :

ผู้วิจัย : เมธาสิทธิ์ คนการ

ผู้ร่วมวิจัย : เสาวนิตย์ โพธิ์พูนศักดิ์, ณัฏฐิมา โฆษิตเจริญกุล และรุ่งนภา พิทักษ์ตันสกุล

หน่วยงาน : สำนักวิจัยพัฒนาการอารักขาพืช

ปี: 2561

ประเภทผลงาน: ผลงานวิจัยเรื่องเต็ม

จำนวนผู้อ่าน: 14 ครั้ง

บทคัดย่อ (Abstract)

          แยกเชื้อรา B. bassiana จากแมลงที่ติดเชื้อราและดินบริเวณแปลงปลูกพืชของเกษตรกร โดยวิธี bating technique จำนวน 15 ไอโซเลท ในปีงบประมาณ 2561 เชื้อราในกลุ่มบิวเวอร์เรียมีโครงสร้างสัณฐานวิทยาของโคโลนีและโคนิเดียเหมือนกันจึงไม่สามารถจัดจำแนกด้วยลักษณะภายนอกได้ ดังนั้นได้นำเทคนิคดีเอ็นเอบาร์โค้ดมาประยุกต์ใช้ในการตรวจสอบและจัดจำแนกเชื้อราในกลุ่มดังกล่าวในบริเวณ 3 ยีน คือ ITS, βt และ α-1factor โดยใช้ primer ITSF1-ITSF2, Bt2a-Bt2b และ EF1FER1R เพื่อเปรียบเทียบหาบริเวณชิ้นส่วนของยีนที่เหมาะสมการจัดจำแนกและตรวจสอบ ในปฏิกิริยา Polymerase chain reaction ร่วมกับการผลจากการวิเคราะห์ Automatic barcode gap discovery พบว่าจากแผนภูมิต้นไม้ของ ITS gene สามารถแยก Beauveria spp. ออกจากเชื้อราโรคแมลงและเชื้อราอื่นๆ ได้ ดังนั้นเบื้องต้นสามารถใช้เป็น DNA marker ในการตรวจสอบและจัดจำแนกเชื้อราในกลุ่มบิวเวอร์เรีย และสามารถประยุกต์ใช้ในการตรวจพิสูจน์พันธุกรรมเชื้อราในกลุ่มนี้เพื่อขึ้นทะเบียนกับกรมวิชาการเกษตรได้ สำหรับการเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอบริเวณ beta-tubulin และ elongation factor เนื่องจากในบริเวณยีนดังกล่าวมีปริมาณ G-C content ที่สูง ทำให้ไม่สามารถเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอเชื้อราบางไอโซเลท และ barcode gaps บริเวณลำดับนิวคลีโอไทด์บน ITS และ βt มีเปอร์เซ็นต์ซ้อนทับใกล้เคียงกัน ส่วนบริเวณยีน α-1factor ซึ่งมีค่ า distribute overlap ระหว่าง intra- และ interspecific genetic variation ค่อนแตกต่างกันผลที่ได้สอดคล้องกับแผนภูมิต้นไม้พบว่า เชื้อราดังกล่าวสามารถแยกกลุ่มย่อยในระดับ B. bassiana species complex

URL Reference :

(ดาวน์โหลด: 8 ครั้ง)

ปรับปรุงข้อมูลเมื่อวันที่ 06-05-2568

แจ้งไฟล์หาย