คลังผลงานวิจัย กรมวิชาการเกษตร

รายงานผลงานวิจัยและพัฒนา

การตรวจสอบการกลายของยีนที่กระตุ้นให้เกิดความต้านทานต่อโรคไวรัสจุดวงแหวนมะละกอ

คำหลัก :

ผู้วิจัย : อรุโณทัย ซาววา

ผู้ร่วมวิจัย : ภรณี สว่างศรี,อำนวย อรรถลังรอง, ศรีเมฆ ชาวโพงพาง

หน่วยงาน : สำนักวิจัยพัฒนาเทคโนโลยีชีวภาพ สถาบันวิจัยพืชสวน มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์

ปี: 2560

ประเภทผลงาน: ผลงานวิจัยเรื่องเต็ม

จำนวนผู้อ่าน: 21 ครั้ง

บทคัดย่อ (Abstract)

          มะละกอ (Carica papaya L.) เป็นไม้ผลที่มีความสำคัญทางเศรษฐกิจ มีพื้นที่เพาะปลูกลดลงเรื่อยๆ สาเหตุมาจากการระบาดของโรคไวรัสใบด่างจุดวงแหวนมะละกอ ปัจจุบันมีรายงานว่ายีนในกลุ่มปัจจัยเริ่มต้นการแปลรหัสพันธุกรรม และกลุ่มกระบวนการ RNA silencing ได้แก่ ยีน eIF4E และ RDR6 เกี่ยวข้องกับความต้านทานต่อไวรัส การทดลองนี้จึงได้ศึกษาการกลายของยีน โดยการโคลนยีน CpeIF4E และ CpRDR6 จากมะละกอ พบว่า ยีน CpeIF4E มีขนาด 711 คู่เบส จาก Start codon ถึง Stop codon สามารถอดรหัสเป็นอะมิโนเอซิดได้ 236 อะมิโน เมื่อเปรียบเทียบกับฐานข้อมูล NCBI พบมีความเหมือนกับ Carica papaya eIF4E, Vasconcellea monoica eIF4E และ Manihot esculenta eIF4E ที่ identity 99, 93 และ 85 เปอร์เซ็นต์ ตามลำดับ สำหรับลำดับอะมิโนเอซิดมีความเหมือนกับ Carica papaya, Vasconcellea goudotiana และ Manihot esculenta ที่ identity 99, 92 และ 80 เปอร์เซ็นต์ ตามลำดับ ในส่วนของยีน CpRDR6 มีขนาด 3588 คู่เบส มีความเหมือนกับ Carica papaya RDR6, Morus notabilis RDR6 และ Nicotiana glutinosa RDR6 มีค่า identity 100, 75 และ 71 เปอร์เซ็นต์ ตามลำดับ ถอดรหัสอะมิโนเอซิด 1194 อะมิโน เหมือนกับ Carica papaya, Manihot esculenta และ Herrania umbratical ที่เปอร์เซ็นต์ identity 100, 71 และ 70 ตามลำดับ การตรวจสอบการกลายของยีน CpRDR6 และ CpeIF4E พบว่ามะละกอตัวอย่าง HF39 ต้น 1 มีลำดับอะมิโนเอซิดที่แตกต่างจากทุกตัวอย่างถึง 36 อะมิโน และพบความแตกต่างของอะมิโนแอซิดที่สัมพันธ์กับตัวอย่างที่ทนทานต่อไวรัส คือ ลำดับอะมิโน P (proline) พบในตัวอย่าง KK80-Florida 67, ขอนแก่น 80 ต้นที่ 2, Florida ต้นตัวผู้ และ Florida ต้นตัวเมีย ซึ่งเป็นตัวอย่างต้นที่ทนทานแต่ไม่พบในตัวอย่างต้นที่อ่อนแอเลย ส่วนยีน CpeIF4E พบความแตกต่างของตัวอย่าง KDTP-Florida 47 เพียง 1 ตำแหน่ง คือ มีลำดับนิวคลีโอไทด์เป็น A (Adenine) ซึ่งตัวอย่างอื่นทุกตัวอย่างเป็น G (Guanine) ส่งผลให้ลำดับอะมิโนเอซิดเปลี่ยนไปเป็น K (Lycine) จากอะมิโน E (Glutamic acid) อย่างไรก็ตามความแตกต่างของลำดับนิวคลีโอไทด์และลำดับอะมิโนเอซิดที่พบอาจเกี่ยวข้องกับความต้านทานของมะละกอ ซึ่งน่าสนใจและจำเป็นต้องศึกษาต่อไปในอนาคต

URL Reference :

(ดาวน์โหลด: 13 ครั้ง)

ปรับปรุงข้อมูลเมื่อวันที่ 29-07-2568

แจ้งไฟล์หาย